Chất lượng nước sau xử lý cao.
Tiết kiệm diện tích xây dựng hệ thống.
Không cần bể lắng thứ cấp.
Vận hành ổn định, chịu được tải lượng ô nhiễm biến động.
Có thể tái sử dụng nước sau xử lý cho nhiều mục đích.

Xử lý nước thải sinh hoạt.
Xử lý nước thải bệnh viện.
Xử lý nước thải khu công nghiệp.
Xử lý nước thải thực phẩm, đồ uống, thủy sản, dệt nhuộm.
Nâng cấp các trạm xử lý nước thải cũ để tăng công suất và chất lượng nước đầu ra.

Tuổi thọ của màng MBR thường từ 5–10 năm (hoặc lâu hơn nếu vận hành đúng quy trình). Trong quá trình sử dụng, màng cần được vệ sinh định kỳ bằng phương pháp rửa ngược hoặc hóa chất chuyên dụng để duy trì hiệu suất lọc và kéo dài tuổi thọ. Thời gian vệ sinh phụ thuộc vào chất lượng nước đầu vào và điều kiện vận hành của hệ thống.